虽然WinISO 6.4在主流“虚拟光驱”功能上表现优良，但早期部分便捷版（绿色版）可能会因为缺乏系统服务加载，导致“挂载”功能不可用。官方原版支持将映像文件挂载到虚拟盘符，使得用户可以无需解压即运行大容量的程序包。同时，WinISO支持直接刻录光盘，并具备处理可启动光盘的能力，能够提取或植入El Torito启动信息段，确保制作的ISO可被BIOS/UEFI识别为可启动介质。